Több százmilliárd forintról szóló számlákat állított ki a kormány az Európai Bizottságnak, eddig a hatszázból 150 milliárd érkezett. Brüsszel korábban azt kérte a kormánytól, hogy amíg nem zárul le az új pályázati rendszer vizsgálata, addig ne küldjön olyan számlákat, amelyeket az új intézményrendszer állított ki. Így az új intézményrendszer által kiállított számlákat csak júniusban küldik ki a Bizottságnak, szintén több mint százmilliárd forint értékben.
A részletekben való fizetés másik oka, hogy hogy kifogyott a keret és a Bizottságnak meg kell várnia a tagállami befizetéseket.
Az EU-s pályázati pénzek kifizetéséről Csepreghy Nándor, a Miniszterelnökség helyettes államtitkára Magyar Nemzetnek elmondta: a nyertes pályázókat először a nemzeti költségvetésből fizetik ki, és néhány havonta küldenek ki Brüsszelbe egy-egy nagyobb számlacsomagot. Április végétől az állam százmilliárdot fizetett ki a pályázóknak, ez az összeg pedig meg is duplázódhat a következő hónapokban.