Blum feltételezését, mely szerint a vizsgálat egyes résztvevői azért kegyetlenkedtek, hogy a Zimbardo által elképzelt eredményeket hozza a kutatás, a pszichológus szintén cáfolta. Zimbardo részletesen szemlélteti, miket csináltak az őrök, majd hozzáteszi: szerinte „egyértelmű, hogy az ehhez fogható cselekedetek túlmutatnak egy feltételezett szerep eljátszásán, amelyben a »keménykedő őrt« kell alakítani”.
További vádak szerint egy fogvatartott csupán megpróbálta leutánozni az idegösszeomlás tüneteit, lényegében szimulált. A megnevezett esetben Zimbardo és csapata a kísérlet megszakítása mellett döntött, a tervezett idő előtt engedték el a fiút. Az eset kapcsán a kutató kifejti: ő maga is kételkedett a rabot alakító reakciójának őszinteségében, de úgy vélte, mindenképp helyénvalóbb lenne szabadon engedni a fiatalt.
Vádak nem csak a kísérleti személyek kapcsán érték a kísérletvezetőket. Blum érvként hozta fel cikkében, hogy Zimbardo csoportjának egy tagja a nyilvánosság előtt hibásnak és hamisnak bélyegezte a kísérletet. Ennek hátterében a Carlo Prescott nevéhez kötött, A stanfordi börtönkísérlet hazugsága című, 2005-ben publikált írás áll. Zimbardo cáfolata szerint ezt az írást azonban nem Prescott írta, hanem Michael Lazarou forgatókönyvíró, aki azután kezdte őt negatív színben feltüntetni, hogy Zimbardo nem neki adta a kísérlet megfilmesítésének lehetőségét.
További kritikaként a szakmaiságot is beemelték: kritikaként fogalmazták meg, hogy egy brit társaság nem tudta megismételni a kísérletet a BBC műsorában. Zimbardo felhívta a figyelmet: a körülmények nem azonosak a két helyzetben, így nem várhatjuk el ugyanazokat az eredményeket. A szakmaiságot más oldalról is megtámadta Blum: felemlegette, hogy Zimbardóék szándékosan nem szakértők által felülvizsgált folyóiratokban publikálták eredményeiket, így elkerülve a visszautasítást. A kutató ennek kapcsán leírta: való igaz, hogy számos nem szakmai felületen szerepeltették a kísérlet eredményét – hogy minél több ember megismerhesse azokat –, ám emellett a tudományos folyóiratok világában is megállták helyüket.
Beismert hibák