Ezután felfüggesztették a fegyelmi vizsgálatig. Mivel Burke felfüggesztése idején is többször bement munkahelyére, az iskola területére, az iskola ideiglenes intézkedést kért a bíróságtól, ami elrendelte, hogy a tanár tartsa magát távol az iskolától.
Burke állítólag 2022. szeptember elsején megsértette a rendelkezést, amiért az iskola újra bírósághoz fordult, hogy tartassák be vele a végzést. Másnap Burke nem jelent meg a bíróságon, és a bíró elrendelte a letartóztatását. 2022. szeptember 5-én Burke-ot letartóztatták, miután a felszólítás ellenére újra belépett az iskola területére. Szeptember 7-én a Legfelsőbb Bíróság elutasította fellebbezését. Majd a bíró további egy hétre előzetes letartóztatásba helyezte Írország egyik leghírhedtebb börtönében, a Mountjoyban, és előírta számára a perköltségek megtérítését.
Enoch Burke azt nyilatkozta, hogy
szívesebben marad börtönben száz évig, mintsem hogy betartsa a bírósági ítéletet.
Hozzátette: a transzneműség ellentmond a Szentírásnak, márpedig ő csak Istennek hajlandó engedelmeskedni.
2022. október 4-én Burke fellebbezést nyújtott be a fellebbviteli bírósághoz az eltiltás ellen, és olyan végzést kért, amely véget vet a fizetett adminisztratív szabadságának (azaz a felfüggesztésnek), az iskolai fegyelmi eljárásnak, és megtiltja az állásából való elbocsátást.
Később, 2022. december 13-án Enoch Burke a börtönből virtuálisan csatlakozott a tárgyalásához, amin megint megtagadta a távol tartási végzésnek való engedelmeskedést, és azt kérte a bírótól, hogy engedjék el, mert ő „nem tolvaj, gyilkos vagy drogkereskedő”, és csak a transzneműséggel kapcsolatos nézetei miatt került rács mögé. A bíró megtagadta a tanár kérését.
2022. december 21-én, amikor az iskola zárva volt a karácsonyi ünnepek miatt, Burke-et kiengedték a börtönből, és tájékoztatták, hogy szabad marad, hacsak nem sérti meg a hatályos rendelkezéseket.
A bíró szerint „nehéz volt elkerülni azt a következtetést, hogy Burke úr saját céljaira használja ki a bebörtönzést”,
és hogy „Burke úr cselekedeteinek egyetlen elfogadható értelmezése az, hogy bizonyos előnyöket lát a börtönbüntetése folytatásában”.