Ez tehát azt jelenti, hogy ha a német határon ellenőrzött migráns például hamisan vallja magát szírnek, vagy a regisztráció ellen tiltakozva megtagadja személyi adatai megadását, büntetőeljárásra és börtönre számíthat. Mindeközben Magyarországon számos alkalommal tagadták meg a regisztrációt a határsértők, büntetőjogi fenyegetettség nélkül.
A határellenőrzés németországi bevezetésével nem függesztették fel a Schengen kódex alkalmazását. Azt továbbra is alkalmazzák, sőt, a lépésre – meghatározott, kivételes esetben – éppen a kódex ad lehetőséget, továbbá az ilyenkor követendő alapvető eljárási szabályokat is kötelező erővel rögzíti, amikor megállapítja: azok a külső határok ellenőrzésére vonatkozó fejezet előírásainak felelnek meg. Ettől még azonban a német határok nem válnak külső határrá, és a kódex is alkalmazásban marad – az új viszonyoknak megfelelően.
Szankciók Schengen szellemében
A rendes szabályok körében a kódex rögzíti, hogy a belső határok átlépésénél nincs helye személyellenőrzésnek, azonban került a joganyagba kivétel és rendkívüli szabály is. Utóbbi a határellenőrzés belső határokon történő ideiglenes visszaállításának esete.
A kódex kifejezetten felszólítja a tagállamokat arra, hogy a nemzeti jogszabályokban szankcionálják a külső határok jogellenes átlépését. A 28. cikk értelmében ezt is alkalmazni kell a belső határokra, ha a határellenőrzést visszavezetik. Ezért vonatkozik a fentebb említett német törvény az osztrák-német határon jogellenesen átlépőkre.