A gyógyítás folyamata rendkívül összetett és nagy szakértelmet igényel. Az alapítvány modern állatorvosi eszközökkel és tapasztalt szakemberekkel biztosítja a megfelelő ellátást. A műtétek, rehabilitációs kezelések és a hosszú távú gondozás mind hozzájárulnak ahhoz, hogy a madarak visszanyerjék természetes életképességüket. A cél minden esetben az, hogy az állatok visszatérhessenek a természetbe, és ott folytathassák életüket.
Az ország minden részéből érkeznek sérült, beteg, védett-fokozottan védett madarak, egyéb vadállatok. Évente már több mint 4500 egyedet fogad a kórház, melyek túlnyomórészt sebészeti/állatorvosi ellátása, utókezelése és teljes gyógyulása után, mintegy 40%-ban visszavadításra kerül, majd pedig visszaengedik a természetbe.
A Madárkórház azonban nem csupán gyógyító intézmény, hanem fontos edukációs központ is. Az alapítvány rendszeresen szervez látogatásokat, bemutatókat és ismeretterjesztő programokat, amelyek során a nagyközönség közelebbről is megismerheti a madarak világát és a természetvédelem jelentőségét. Ezek az élmények különösen fontosak a fiatalabb generáció számára, hiszen a környezettudatos szemlélet kialakítása már gyermekkorban elkezdődik.