A Pécsi Egyházmegye az elmúlt egy évben elkészítette a kiviteli terveket, részben lefolytatta a közbeszerzési eljárásokat, így a kivitelezési munkák egy része már 2013 őszén elkezdődött. A Martyn-ház és a zarándokszállás felújítása már zajlik, és a Széchenyi téri dzsámi rekonstrukciója és restaurálási munkái is a tervezett ütemezés szerint folynak.
A következő fázisban a székesegyház és a püspöki magtár újul meg, márciusig az összes, még hátralévő munkálat is elindulhat. A tervek szerint a felújítások 2015 elejére elkészülnek.
A beruházások során új vendéglátóhelyek és ajándékboltok nyílnak, valamint egy új rendezvénytermet is kialakítanak. A könnyű tájékozódást információs pontok fogják biztosítani, a gyermekeket pedig külön foglalkoztató műhely várja majd. A fogyatékkal élők számára az épületek akadálymentesítése is megvalósul.
A beruházás keretében felújítják és látogathatóvá teszik a székesegyház délkeleti tornyát, továbbá a tető javításával megszüntetik a bazilika beázását, védelmet biztosítva Székely Bertalan és Lotz Károly felbecsülhetetlen értékű freskóinak. Megnyílik a látogatók előtt a püspöki palota és annak kertje, valamint a kertből a püspöki pincészetbe vezető titkos alagút. A pincészet mellett borászati kiállítást rendeznek be, a magtár pedig átépítését követően rendezvényhelyszínként működik majd.