1944 novemberében aztán felgyorsultak az események. November 4-én a németek felrobbantották a Margit-hidat. Az sem zavarta őket, hogy számtalan autó és a villamos is éppen a hídon volt. Rafael atya valószínűleg a Margit körúti plébánián hallotta a robbanást. Az egyik rendtársával azonnal a helyszínre sietett, s annyi sebesültet látott el, amennyit csak tudott. Ő is megsérült, de nem törődött vele, hiszen tudta, indulnia kell.
Egyházi menleveleket vitt magával, hogy kimentse a koncentrációs táborokba indult halálmenetből az embereket.
Rafael atya napokkal később utolérte a szerencsétleneket és sokan neki köszönhették az életüket.
Aztán a II. világháború véget ért. Rafael atya is fellélegzett, azonban a nácik után hamarosan a kommunistákkal is meggyűlik a baja. 1949-ben Újhatvanba helyezték a helyiek emlékezete szerint halk szavú, derűs és barátságos atyát. Ekkor már a kommunisták voltak hatalmon, s a következő év nyarától már nem csak szóban ostorozták a történelmi egyházakat, megindult a szerzetesek elhurcolása is. A rendszer első számú célpontja lett a „klerikális reakció”. Rafael atya és rendtársai 1950. június 19-én hajnalban arra ébredtek, hogy az újhatvani ferences kolostornál két teherautó fékezett le. Tatáról és Mosonmagyaróvárról begyűjtött piaristák, szerzetesek és apácák voltak a platókon. A teherautóknak hamar híre ment, a hívek pedig azt hitték, el akarják vinni Rafael atyáékat, ezért a templom és a kolostor köré sereglettek. Tüntetés kezdődött, estére csaknem ezer ember gyűlt össze.